Ahoj,

jen pro doplnění, v labu máme jakýsi (zatím nevyzkoušený) mikrotom.
Tekutý dusík můžu "nafasovat" když se dá vědět dost předem.

P

Dne 7.3.2016 v 10:05 Radka Haneckova napsal(a):

> Ahoj!
> Je to v skutku zajimavy projekt!
> Jak uz psala Barney, obecne plati ze Brmlab nema profesionalni laboratorni
> vybaveni kterym disponuji akademicke instituce zabyvajici se vyzkumem
> tohoto typu. Vsechno si delame "na kolene", primarne samozrejme protoze na
> to nemame potrebne finance.
> Ale zkusim ti aspon trochu poradit, jak by k tvemu tematu bylo mozne
> pristupovat experimentalne. V prvnim rade - co konkretne planujes pouzit
> jakozto biologicky material? Mluvis o mysi nervove tkani - kdyz tim mas na
> mysli celou (zivou) mys, rada bych te upozornila ze experimenty s zivymi
> zviraty jako jsou mysi jsou prisne regulovane zakonem o ochrane zvirat:
> http://eagri.cz/public/web/mze/legislativa/pravni-predpisy-mze/tematicky-prehled/Legislativa-MZe_uplna-zneni_zakon-1992-246-viceoblasti.html
> - takze kdybys treba planoval neco na zpusob "mysi neco injikuju a pak ji
> zkusim zmrazit" uz se dle toho zakonu jedna o experiment na pokusnem
> zvirati na ktere je nutne mit nejdriv akreditaci, pak schvaleny projekt
> pokusu etickou komisi, prostory urcene k chovu pokusnich zvirat atd.
> Jelikoz se jedna o (verejny) skolsky projekt, mohli by z toho pro tebe
> vyplynout dost neprijemne dusledky, proto bych ti delani cehokoli na zive
> mysi vubec nedoporucovala.
> Schodnejsi alternativa by byla prace jenom s casti mysi. Tady jsou v
> podstate dve alternativy, a to prace s celou tkani/organem nebo s kulturou
> zivych bunek. Kultura zivych bunek ale ma za predpoklad prave to drahe
> laboratorni vybaveni - potrebujes specificke zivne medium ve kterem bunky
> muzou rust, sterilni laboratorni plast a sklo, a hlavne (a to je nejvetssi
> problem) specialni inkubator ktery krom fyziologicke teploty umi udrzovat
> parcialni tlak CO2 na konkretni urovni - co je extremne drahe vybaveni a je
> tezke neco takoveho sestrojit sam (hlavne kdyz rikas ze te tlaci cas).
> Proto mi asi nejrealistictejsi prijdou pokusy na tkani - napriklad prace s
> mysim mozkem. Zakon o ochrane zvirat zabiti mysi nedefinuje jako pokus,
> takze zabit mys a nasledne z ni vypreparovat mozek je z teto strany
> naprosto v poradku. Anatomicky atlas mysi:
> http://www.informatics.jax.org/cookbook/imageindex.shtml Samozrejme ze
> takto komplexni tkan nejde udrzet na zivu, ale myslim ze zajimave data o
> kryoprotektivite ruznych latek by slo nasbirat i na cerstve byt mrtve
> tkani: ihned po vypreparovani umistnit mozek do fyziologickeho roztoku a
> nasledne jej zkouset perfuzovat latkami ktere chces zkoumat. Nasledne mozek
> zmrazit, rozmrazit, narezat na tenke rezy, obarvit a mikroskopem zkoumat
> jak moc zustala zachovana bunecna struktura. Na takovyhle postup
> nepotrebujes zas az tak drahou techniku - mrazeni musi probehnout co
> nejrychleji, takze uplne nejlepsi by byl tekuty dusik (ktery lze zakoupit),
> alternativne suchy led. Krajet pak lze ziletkou nebo skalpelem, na barveni
> a pripravu na mikroskopovani staci zakladni vybaveni typu mikroskopovaci
> sklicka a opticky mikroskop. Zde najdes inspiraci jak se takovy preparat
> dela: https://cs.wikipedia.org/wiki/Histologick%C3%BD_prepar%C3%A1t
> Tak snad jsem pomohla aspon radou, hodne stesti!
>
> chido
>
> 2016-03-07 8:45 GMT+01:00 Blanka "Barney" Laudová <blandrium@gmail.com>:
>
>> Ahoj Ivane,
>>
>> zájem minimálně jednoho člena jsi právě získal. Co se dalších bodů tvého
>> dotazu týče, bude věc trochu komplikovanější. Faktem je, že "biolabí"
>> sekce Brmlabu je v současnosti prakticky neaktivní, hlavně pro
>> zaneprázdněnost jejích členů (kterých je navíc v rámci celého Brmu jen
>> hrstka; většina členů Brmlab je prioritně IT a elektrotechnicky
>> zaměřená). Což není fakticky překážkou pro tvou práci tam; jen to
>> znamená, že musíš počítat s tím, že ačkoli budeš mít podporu členů, gró
>> tvé práce bude ležet na tobě samém. Druhá věc je vybavení. Tedy - co
>> představuje "technické zajištění"? Chemlab je v rámci možností vybaven
>> velice dobře; co se techniky týče, nemám vůbec představu, co bys mohl
>> potřebovat. Profesionální aparaturu ti pochopitelně nezajistíme. Dá-li
>> se potřebné zařízení "vyrobit", pak jsi na správném místě.
>>
>> Zkus nám tedy blíž nastínit svou práci a jak a s čím by měla probíhat,
>> lidi, co by se ve věci mohli angažovat, se určitě ozvou.
>>
>> Brm,
>>
>> Barney
>>
>>
>>
>> Dne 07.03.2016 v 0:20 Pavel Ruzicka napsal(a):
>>> Preposilam na nas biolab mailing list.
>>>
>>> On 03/07/2016 12:12 AM, Ivan Petrov wrote:
>>>> Dobrý deň,
>>>>
>>>> již v dávne době zahlédl jsem na Vaše stránce
>>>> http://brmlab.cz/project/start oznámení o možnosti získat podporu nebo
>>>> zájem lidí o svůj projekt pod Vaší "záštitou", ovšem jenom teď s tím
>>>> potřebuju poradit - a kvůli tomu, že nejsem ve Vaší organizaci zbehlý,
>>>> obrácím se na Vás takou obecnou a veřejnou cestou, jaká je táto.
>>>>
>>>> Skutečnosti je, že jsem studentem oktávy osmiletého gymnázia v Teplicích
>>>> a spolu se spolužáčkou se podílime na vypracováni seminární práce. Ovšem
>>>> kvůli náročnosti tématu, a to studie vlyvu krygoenních teplot na nerové
>>>> buňky myši domáce pod ochranou kryoprotektiv, jsme již několikrát
>>>> narazili na technické potíže v uskutočnění praktické části naše práce,
>>>> konkretnějí v sehnání prostor, potřebného zařízení v podobě přístrojů a
>>>> chemikalií. Ale po tom, co jsem prohlédl Vaši stránku a na vlastné oči
>>>> se přesvědčil, že pracujete nebo plánujete pracovat na mnoha zaujímavých
>>>> projektech s velkými perspektivy a z oblastí různých vědných oborů a,
>>>> jako mohu soudit, minimálním financováním, ujistil jsem sám sebe, že v
>>>> někom z Vašeho týmu by mohla moje práce vyvolat alespoň nějaký zájem a
>>>> dovolil bych si se dočkat kolektivní podpory a solidarity.
>>>>
>>>> Podstatou celé moje práce je zkoumání rozdílů v poškozeních nervové
>>>> tkáně při kryogenním zmrazování za použití různých typů tzv.
>>>> kryoprotektiv, příp. funkčnosti po rozmrazení a vypracování nejlepšího a
>>>> nejefektivnějšího způsobu a metodiky rozmrazování tkáně pro zachování
>>>> všech jeji funkcí. Je naprosto zřejmé, že při takovém popisu náplně naše
>>>> seminárky učitelé jenom koulili očima :) a potřebné technické zajištění
>>>> a odbornou pomoc jsme, pochopitelně, nedostali.
>>>>
>>>> Osobně se v tomhle ohledu považuji za nadšence, i když hranice mého
>>>> vzdělání formálně nepřesáhla maturitní zkoušku - právě proto velice bych
>>>> nerád zahazoval tenhle projekt do "popelnice" a rozvíjel ho dál, mnohem
>>>> dál, než by se mohlo očekávat od středoškolské seminární práce.
>>>>
>>>> Jediné komplikace mohl by uskutečnit časový rámec, který nás tlačí čím
>>>> dál tím více, ale doufám, že časová vytíženost nebude na místě a při
>>>> důkladnem fungování všechno by mělo být v potřebném čase splněno.
>>>>
>>>> Doufám, že Vás moje otázka nezaskočila a mohu očekávat od Vás alespoň
>>>> zpětnou vazbu ohledně toho, jestli mohu získat podporu a zájem členů
>>>> Vášho týmu nebo nikoliv.
>>>>
>>>> S pozdravem a úctou,
>>>>
>>>> Petrov I.V.
>>>> _______________________________________________
>>>> Rada mailing list
>>>> Rada@brmlab.cz
>>>> https://brmlab.cz/cgi-bin/mailman/listinfo/rada
>>> _______________________________________________
>>> Biolab mailing list
>>> Biolab@brmlab.cz
>>> https://brmlab.cz/cgi-bin/mailman/listinfo/biolab
>>
>> _______________________________________________
>> Biolab mailing list
>> Biolab@brmlab.cz
>> https://brmlab.cz/cgi-bin/mailman/listinfo/biolab
>>
>
>
>
>
>
> _______________________________________________
> Biolab mailing list
> Biolab@brmlab.cz
> https://brmlab.cz/cgi-bin/mailman/listinfo/biolab
>

Dne 7.3.2016 v 03:14 SysOp napsal(a):
> Ahoj,
> tohle plati jen pro zpravu s major-msgid 32, pro ostatni je to jinak.
V priloze
> posilam pseudokod funkce, ktera to vyhodnocuje, jak mi to vyplivla IDA.
>
> 1 byte dat (5 byte zpravy)  se pouzije, jako index do  tabulky, kde
jsou 4 byty
> pro kazdou hodnotu, ale myslim, ze pro odpoved na "mode pers" neni
vyplnena,
> nebo alespon ne cela.
>
> Se zapnutim tracovani to pri zprave
> 10 32 00 0b 00 03 43 00 44 00 04 00 12 70 00 02 10 03 5a pise
"redemarrage TR
> mode : 0x02" - reboot
> a pri
> 10 32 00 09 00 02 46 00 47 00 02 00 16 75 10 03 5a pise "init mode perso"
>
> Jeste posilam pseudokod funkce, ktera pravdepodobne vyypisuje
debugovaci hlasky
> pro jednotlive zpravy (mozna i vola odeslani zpravy, to nevim).
>
>
> SysOp.
>
>
> On 03/02/16 23:20, P wrote:
>> udělal jsem i pár dalších pokusů a vyšlo mi:
>>
>> 10 - start
>> 32 00 - cmd opcode (16b)
>> 08 00 - délka (16b), max hodnota 0x10 00
>> ff 00 00 00 00 00 16 75 - data (délka B)
>> 10 03 - stop? suffix? (16b)
>> a5 - xor
>>
>> - stanice odpoví vždycky stejně -> nejspíš naznačuje že to je špatně
>>
>> Vyzkoušel jsem i pár dalších možných CMD, ale stanice na nic nereaguje.
>>
>> Bude to asi chtít koukat víc do assembleru.
>>
>> P
>