New subject: [Biolab] [Rada] Otázka o možné podpoře

9 Mar 2016


      Ahoj Ivane,
podle toho, co píšeš, bychom ti snad mohli poskytnout vše, co potřebuješ.
Mám na tebe dotaz: z čeho při plánování vycházíš, máš k dispozici nějaké
konkrétní materiály? Nějakou vědeckou práci nebo podobně, co tě vlastně
inspirovalo a podle čeho chceš výzkum řídit - a podle čeho se dá taky
odhadnout, jestli použitým postupem vůbec máme šanci zjistit to, co
zkoumáme. Rozumíš, je mrzuté, když se snažíš něco vybádat, věnuješ tomu
hafo času a prostředků, zatím ti z toho nic neleze... A pak projde okolo
někdo, kdo věci náhodou trochu rozumí, a řekne ti "hele děláš to všechno
blbě, postupem, který jsi použil, tam změny, které hledáš, najít
nemůžeš, protože xy" :-)
Jinak ohledně postupů ve výzkumu myších tkání vřele doporučuji obracet
se na Chido, která ti již taky psala - je to v Brmu prakticky jediný
člověk (alespoň pokud vím) vyloženě profesionálně se zabývající výzkumem
v bio-vědách, přitom je schopná věci velmi dobře vysvětlit i laikovi; v
Brmlabu nenajdeš povolanější osobu.
Co se týče zpracování preparátů na mikrotomu, ten máme v plánu zaběhnout
já s Pinkym. Původní plán byl dělat na něm parafinové preparáty; jestli
se dá využít i na řezy ze zmrazáku, zatím nevíme (není to standardní
přístroj používaný na patologii v nemocnicích; víc o něm nevím, ještě
jsem ho ani neviděla). Takže bude jedině fajn, když se do toho opřeš a i
nás tím budeš motivovat k tomu, abychom s tím společně hnuli. Ohledně
řezů, jejich metodiky zhotovení a prohlížení tak, abychom tam viděli, co
hledáme, mám k dispozici konzultanta-patologa.
S mikroskopem (zvaným makroskop - pochopíš, až uvidíš) se má věc tak, že
t.č. nemá světelný zdroj pro prosvěcování preparátů. Ten je nutné
zkonstruovat - pravděpodobně to nebude nic nijak zvlášť obtížného, ale
je prostě třeba se k tomu dokopat. Makroskop je pod Pinkyho patronátem,
takže je dobré se obrátit na něj a domluvit se (taky už ti v tomhle
vláknu psal).
Brm,
Barney
Dne 09.03.2016 v 8:19 Ivan Petrov napsal(a): > Ahoj, > > děkuju všem za
poskytnuté rady a vyjadřený zájem, budu se snažit konečné > odpovědět a
udělat to v stručnosti. > > Samozřejmě, fakt toho, že budu pracovat
většinu času sám, nepovažuju za > velký problém, neboť původně se to tak
i plánovalo, takže co se tohto týče, > vše je v naprostém pořádku. Také
jsem počítal s tím, že u nebudu mít k > dispozici profesionální
aparaturu, kterou de facto ani nepotřebuju a dá se, > jak bylo řečeno,
něčim vhodným nahradit. Vlastně jedinou věci z technického > vybavení,
která je nejdůležitější a potřebuje alespoň trochu nějakou >
profesionální úroveň, je právě ten optický mikroskop. Plus Dewarová
nádoba > vhodného objemu, protože pochybuju, že by se zrovna dala udělat
"na koleně". > > O legislativných omezeních zacházení se živým zvířetěm
jsem poučen, navyše > by mě nikdy nenapadl onen postup se zmrazením
živého tvora, přímo zhmotněný > sadizmus, jak by se dalo říct :) Ostatně
je pravda, že plánovali jsme > použít jenom myší mozek a to takovým
způsobem, že ho nakrájíme na krychle > se stranou 1 až 5mm - podle toho,
jak dobře to půjde, neboť s myším mozkem > jsem doposud nepracoval.
Ovšem, aby to mělo alespoň nejmenší věděckou > hodnotu, chtěli jsme na
každý způsob zmrazování (s jiným kryoprotektivem) > použít několik
desítek vzorků + kontrolní skupina, samopochopitelně. > Celkově to
vychází v rozmezí 100 - 200 vzorků, ale přesný výpočet, kolik > budeme
potřebovat vzorků a tím pádem i myší, uděláme co nejdřív. > > Také do
konce týdne uděláme seznam potřebné aparatury (kromě mikroskopu a > té
nádoby to budou po většině drobnosti) a pravděpodobně vylíčíme přesný >
postup práce, prottože na detailech jsme se doposud nezhodli. > > Tekutý
dusík by byl velmi vhod a jsem přesvědčen, že i mikrotom by rozhodně >
ulehčil našou "řeznickou" práci - byli bychom velmi rádi, kdyby tyto
věci > byli k poskytnutí. > > S pozdravem, > > Petrov I.V.

Re: [Biolab] [Rada] Otázka o možné podpoře